福建医科大学附属协和医院前身是福州基督教协和医院（又名Willis F. Pierce Memorial Hospital），为创建于1860年的福州圣教医院与创建于1900年的马高爱医院合并而成，为八闽现代医学的发祥地。现为一所集医疗、教学和科研为一体的大型三级甲等综合性医院。医院座落在福州市中心风景秀丽的于山之麓，现有开放床位2200张，年门诊病人超150万人次，年收治住院病人超6万人次，开展各类手术5万余台。现有员工2800余人。其中正、副高职称（含教授、副教授）400余人，拥有博士、硕士学位的医师占医师总数的60%，有国家突出贡献专家4人、省部级优秀专家9人、享受政府特殊津贴专家32人、入选国家级“百千万人才工程”和省厅级“百千万人才工程”人选68人。
福建医科大学附属协和医院临床科室齐全，其中血液内科和心脏大血管外科是国家临床重点专科，血液内科、内分泌内科、普通外科、胸心外科4个学科居全省首批10个重点学科之列，烧伤外科、心血管内科冠心病专业、小儿内科医学心理学专业跻身省内10个领先医疗特色专业。血液病学专业也是福建省“211”工程唯一的西医临床重点学科。福建省超声医学、院内感染、烧伤治疗质控中心也挂靠在该院。此外，神经外科、泌尿外科、肿瘤科、消化内科、神经内科、老年医学科、介入科、超声医学科、影像等专业的诊疗技术也有较突出的优势和特色。近年来，医院开展了大量的新技术、新项目，其中同种异体心脏移植手术的例数及成功率均属全国领先，儿童心脏移植填补国内空白；心脏移植后的肝移植、双肺移植、异基因造血干细胞移植治疗白血病、心脏不停跳冠脉搭桥术、急性心肌梗塞的介入治疗、腹腔镜肝癌、胃癌切除术及结、直肠癌根治术、神经内窥镜下颅内病灶切除术、超声造影与超声介入无水酒精量化治疗肝癌等技术已达到国内先进水平。
福建省血液病、内分泌、肝胆外科、胸心外科等11个省级研究所及其他10个校级研究机构挂靠医院，医院重视发挥科技力量雄厚的优势，近年承担国家“863”、“973”、国家自然科学基金、卫生部、教育部、省教育厅、科技厅等大量科研课题，先后获得3项国家科技进步奖、国家自然科学奖，312项省、部级等科研成果奖。
协和临床医学院设有54个教研室（组）、1个临床医学博士后流动站、22个博士学位授权点和32个硕士学位授权点。承担福建医科大学的临床医学、医学影像学、医学检验学、药学和护理学等专业的临床教学任务，每年还招收培养博士和硕士学位研究生120余名。
福建医科大学附属协和医院拥有大批国际先进医疗设备，如：美国GE公司宝石能谱CT、德国西门子双源64层CT、40层CT、3.0T核磁共振，美国GE公司PET-CT、全数字化血管造影机（DSA）、双探头SPECT，美国瓦里安直线加速器及GE大孔径CT模拟定位机，癫痫刀，德国多尼尔多力王者体外震波碎石治疗系统，头颅伽玛刀等。医院大型设备配置居省内领先水平。目前医院初步实现了管理电脑化及后勤服务社会化。
福建医科大学附属协和医院重视两个文明建设，加强职业道德教育，努力提高医疗服务质量，1994年被卫生部评为福建省首批“三级甲等医院”，并先后被授予“全国卫生系统先进集体”、“全国创建‘以病人为中心，优质服务’百佳医院”等称号。医院全体医务人员秉承“严谨、求精、勤奋、奉献”的协和精神，竭诚为海内外人民的健康提供一流服务。
福建医科大学附属协和医院新院徽图案以古朴、典雅、庄严的红楼为主体，体现了协和悠久的建院历史和独具特色的建筑标识。红十字是一个给有困难的人予以帮助的组织标志，弘扬“人道、博爱、奉献”的红十字精神，保护人民的生命和健康，促进人类和平发展，也寓含医院前身为教会医院的特殊历史背景。橄榄枝寓意生命、健康与希望，象征医院安宁、祥和与活力，体现医院崇尚 “绿色人文”，营造良好的就医环境，实现“以病人为中心”的服务宗旨。
